В музее экспонируются многочисленные фотографии великой княгини, охватывающие все периоды ее жизни, а также фотографии царской семьи разных лет. Восстановлен по дореволюционным фотографиям приемный покой Елизаветы Федоровны, где она принимала членов императорской фамилии и простых посетителей. Здесь же можно увидеть удивительной красоты вышивки, которые, вероятнее всего, были сделаны Елизаветой Федоровной; при входе в приемный покой стоит деревянная статуя святой Елизаветы Тюрингенской, в честь которой была наречена великая княгиня при рождении.
В музее представлена мебель и предметы интерьера конца XIX — начала XX вв., в том числе и рояль, который был заказан Елизаветой Федоровной для обительских сестер и который не покидал обитель даже после ее закрытия. В молельной комнате, где уединялась
Отдельный зал посвящен крестовым сестрам обители — можно увидеть их личные и групповые фотографии, образцы вышивок, дипломы медицинских сестер.
В музее находятся многие личные вещи о. Митрофана, а также предметы мебели и утварь из его дома в с. Владычне. В числе экспонатов — Иверский образ Божьей Матери, который сопровождал священника во время войны 1904−1905 гг. и который не раз упоминается им на страницах «Дневника полкового священника». Здесь хранится крест на георгиевской ленте — единственная военная награда, которую может получить священник на войне и которая была вручена о. Митрофану Николаем II лично.
Покровский собор обители, действующий в наши дни, представляет собой часть мемориального комплекса обители. Верующие могут приложиться к ракам с частицами мощей святых Елизаветы, Варвары и о. Митрофана. После церковной службы в соборе можно провести достаточно времени, чтобы полюбоваться его строгой архитектурой, простым внутренним убранством и росписями Нестерова, которые были отреставрированы к столетнему юбилею обители. Единственное, чего сейчас лишены паломники и туристы — это спуск в крипту, нижнюю часть собора, куда еще год назад можно было попасть с экскурсией. Из-за плачевного состояния некоторых фресок доступ в крипту ограничен.
В церковной лавке обители можно приобрести книги духовного содержания, труды по истории России, жизнеописания последних Романовых. В продаже имеется сборник писем Елизаветы Федоровны в хорошем переводе с английского и французского и с комментариями, а также — две книги, написанные Митрофаном Сребрянским и совсем недавно переизданные на отличной бумаге. Это «Дневник полкового священника», по сути — летопись русско-японской войны, и брошюра «Покровский собор», небольшая книга, повествующая о постройке и внутреннем убранстве Покровского собора, ставшего символом обители.
Посещение Марфо-Мариинской обители будет интересно как людям религиозным, так и светским, которые интересуются русской историей и культурой, а также тем, кому интересна и близка личность великой княгини Елизаветы Федоровны.